В SF3 сюжет это комбинация приквела (нам дают историю знакомства основных персонажей) и концовки существования Агентства. Все это подается как дача свидетельских показаний и воспоминания главных героев игры. В самом конце мы снова убъём Мару Арамову (или как там она зовется в вашем переводе игры).